A two minute primer on mendelian randomisation

Professor George Davey Smith gives us a brief overview of Mendelian randomisation. What is it, and how does it help us to understand the causal impact of behaviours, such as smoking, on health?

[Scooby_NZ]

Indeed the clearest and simplest explanation about Mendelian randomisation studies that I have come across. Thank you very much for this! 👍✌

[garthkroeker]

Pretty much the most efficient and concise explanation of a complex topic that is possible in 2 minutes and 16 seconds.

[charlottehadfield]

This has been the clearest explanation of mendelian randomisation I've heard. thank you so much! Love the animations!

[profitgeoff]

Doesn't this really amount to a population-level survey of an incident phenotype, which you then correlate (severity or incidence) with the inheritance of known or random-panel variants? Not sure how this differs from standard GWAS.

[taotaotan]

We can rule out the possibility of the causality of this particular gene by this technique, but there are infinite confounders (could be environmental factors or other genetics). Is it possible to rule out all possibilities?

[bejoym]

Awesome explaination. Super clear. Thankyou! I'm sure that 2 minute clip of genius took a lot longer than 2 minutes to put together

[mandel]

What if the SNP in question is associated with phenotypic differences that significantly affects the environment of the patient? I.e. the SNP causing sickle cell anemia, which is overrepresented among Black Americans. Would it not be possible for a SNP like that to lead to spurious associations between exposures and outcomes? I.e., you could think that the sickle cell anemia SNP leads to higher rates of Diabetes - but it's not the SNP in itself which is the cause of that, but a complex series of socioeconomic factors associated with being Black in the US?

[vhs]

For those who say the video is too fast, it can be slowed down. Try 0.75 speed.

[zy]

What if there is other polymorphism that is affecting the outcome and whose segregation in meiosis is linked (could be due to genetic linkage or biased mating selection) to the polymorphism you are studying, then it could result in confounding and not causation

[zy]

So to conduct Mendelian randomization you will always need to find a polymorphism that causes differences in the modifiable exposure that you hypothesize causes the disease?

[ravivaradhan]

I found it to be too fast like a sprinter blasting off the block. What's the harm in slowing down a bit and making it a 3-minute video?

[KernuTheWise]

los epidemiologos etan interesados en entender factores relacionados a la salud y a la enfermedad
los fumadores tienden a morir antes que los no fumadores, eso pareceria cierto.
pero desenredando causa-efecto puede ser dificil
los fumadores son diferentes en general que los no fumadores, son propensos a tomar mucho alcohol
y tienen una dieta menos saludable, pero aunque fueramos a medir estos factores, podriamos no medirlos
perfectamente, o puede haber otros que no medimos tambien como cuando la gente se enferma pueden reducir
o dejar de fumar, lo que puede erroneamente sugerir que la reduccion en el fumar apunta a peor salud
podriamos asignar aleatoriamente 50000 personas a fumar y 50000 personas a no fumar y seguirlos y
monitorear su salud, esto remueve la posibilidad que otro factor cualquiera peude ser responsable
por cualquier diferencia que podemos ver en su salud a largo plazo, pero esto no es ni etico ni practico
por fortuna todos hemos sido recrutados para un experimento sin saber.
cuando hemos nacido, nuestro genes que pasaron al azar de generacion en generacion
influencian cuando comemos tomamos, fumamos y mas.
estas influencias geneticas no son afectadas por nada que vos elijas o no hacer en tu vida
no estan relacionadas a los factores confusos.
podemos usar este conocimiento para aprender acerca de causa y efecto.
agrupando gente de acuerdo a su codigo genetico.
este metodo es llamado aleatorización Mendeliana
Por ejemplo fumadores que tienen una version de un gen llamado CH RNA 5 tienden a fumar mucho menos
que fumadores que tienen una diferente version.
cuando agrupamos gente de acuerdo a que version de este gen ellos tienen encontramos que gente con la version
del gen asociado con fumar mucho suelen morir mas jovenes pero es el gen el que influencia
que tanto vivimos, de otra manera:No lo pensamos.
cuadno miramos al mismo gene en no fumadores, no hay efecto en la expectativa de vida.
Entonces, el efecto debe ser impulsado por el fumar.
usando este metodo puedes mostrar que fumar causa cancer de pulmon, enfermedades de corazon y respiratorias y muchas otras enfermedades
pero no parece influenciar el choque o la ansiedad,
La aleatorizacion Mendeliana ha empezado a decirnos sobre factores que influencian nuestro riesgo
de enfermar.
Ahora estamos usando el mismo enfoque en otros caminos, para mirar a muchos factores de riesgo agrupados y a ver que progresion de enfermedad
influencia lo que nos puede ayudar a desarrollar nuevos tratamientos

[purador]

Am I the only one who finds the flat tone coupled with lightning speed extremely annoying? If you're gonna read off a script, why don't you just post the script instead for people to understand better?

[MITSCHLAG]

Please slow down. Delivery was like a machine gun. Hard to follow. Thanks.