Счёт-фактура и потеря права на УСН или ЕНВД

Бывают случаи, когда клиент при заключении сделки просит составить счёт-фактуры с НДС. Законодательством это не запрещено, поэтому предприниматели (организации) чаще всего соглашаются. Но тут возникает вопрос: НДС — это налог общего режима и обязательно ли в таком случае предпринимателю или организации на УСН или ЕНВД переходить на общий режим, если составлен счёт-фактура с НДС? Возможны ли какие-либо претензии со стороны налоговой инспекции в таком случае?