Φυσικό περιβάλλον - Χλωρίδα

Το φυσικό περιβάλλον του νησιού, διαμορφωμένο από τη γεωλογική του δομή, τη γεωγραφική θέση, το ιδιαίτερο ανάγλυφο, και την ανθρώπινη δραστηριότητα, είναι πλούσιο και σημαντικό. Το νησί βρίσκεται στα όρια τριών πελάγων, του Ιονίου, του Αιγαίου και του Κρητικού.
Η υψηλή βιοποικιλότητα καθώς και η εμφάνιση ειδών που ενδημούν στη νότια Πελοπόννησο και στην Κρήτη οδηγεί στο συμπέρασμα ότι τα Κύθηρα και τα Αντικύθηρα μπορούν να θεωρηθούν το σημείο συνάντησης δύο φυτογεωγραφικών περιοχών, αυτών της Πελοποννήσου και της περιοχής Κρήτης-Καρπάθου. Λόγω της γεωγραφικής θέσης του, το ποσοστό ενδημισμού είναι υψηλό με μεγάλο αριθμό τοπικών ενδημικών ειδών. Έξι φυτικά είδη και υποείδη θεωρούνται στενότοπα ενδημικά του νησιού, ενώ ο αριθμός των καταγεγραμμένων χλωριδικών taxa είναι πάνω από 1000, αν και ο επίσημος αριθμός που υπάρχει στην μέχρι σήμερα βιβλιογραφία είναι 820.
Στα Κύθηρα κυριαρχεί η μεσογειακή σκληροφυλλική βλάστηση σε θαμνώδεις και δασώδεις εκτάσεις.
Σε όλη την έκταση του νησιού υπάρχουν ελαιώνες, μικτές καλλιέργειες, λιβάδια και θαμνότοποι που αναπτύχθηκαν εκεί όπου καλλιέργειες του προηγούμενου αιώνα έχουν εγκαταλειφθεί. Πολλοί από τους ορεινούς όγκους που βρίσκονται ανατολικά και δυτικά του κεντρικού οροπεδίου είναι πια απογυμνωμένοι ή με πολύ αραιή φρυγανώδη βλάστηση λόγω των διαδοχικών πυρκαγιών και της ανεξέλεγκτης βόσκησης από ανεπιτήρητα κατσίκια, που υπάρχουν στις περιοχές αυτές.