Swiss-Model: Construir modelos de estructura 3D de proteinas por homología

En este vídeo se muestra como construir un modelo de estructura 3D para una proteína, dada su secuencia de aminoácidos, lo cual nos puede servir para estudiar como puede afectar una mutación al plegamiento proteico.

[Dravenkiller]

Estaba buscando esto, me ha sido de gran ayuda.
Estoy usando Chimera para visualizar una blaTEM pero no podía compararla con mi TEM encontrada en mi secuenciación porq la tengo en secuencia aminoacídica.
Gracias por compartir esto.

[upobioinfo]

Me alegro que sea de utilidad :-)
En principio este tipo de modelización de estructura 3D se basa, como muchas otras herramientas bioinformáticas, en esa historia evolutiva común u homología. Aunque es cierto que en casos de convergencia evolutiva también podría funcionar, aunque no con tan buenos resultados, debido a esa diferente historia evolutiva, en el caso de la convergencia.

[vanessacortes]

hola y que hago si mi coverage es muy bajo que otro programa hace una busqueda mas cercana

[pascualanaya]

Por homología no, será por identidad de secuencia o dominio :-). Homología implica ancestro común, sin embargo proteínas con un mismo tipo de dominio (por ejemplo homeobox) no tienen por qué ser homólogas.

Gracias por el video! Voy a mirar una de las proteínas con las que trabajo pero ya!

[raulornelas]

Hola, buen video. Disculpe, al momento de hacer el modelado, en la secuencia de este salen aparte de la plantilla 3 modelos: A, B y C. Mi pregunta es, cómo se puede quitar dos modelos, o en caso de que no se pudiera, influyen en algo?

[fernandojpl]

hola, buen vídeo. ¿Cómo hago para meter las mutaciones en mi proteína salvaje? me sería de gran ayuda la respuesta

[oswasuapo]

Cuál es el programa que utiliza en el minuto 5:42? 🙏